待内壁刷洗完毕后，清洗人员会打开排水阀，或用抽泥沙的水泵将池底的沉淀物直接排到下水道，然后用清水冲洗水箱，并配制消毒液，均匀洒在水箱内壁表面消毒，再用清水将水箱冲洗干净，会冲洗2-3次。整个清洗过程需要2-3小时。每次清洗水箱后，都会将水质样片送到疾控中心等检测单位进行检测，检测水箱里的水的余氯、浊度等指标，确保居民引用水安全。
二次供水蓄水池清洗方案：一、清洗前合理控制好蓄水池水位,将水池水位控制在10－30公分深左右；二、提前准备好清洗工具和消毒粉和水池内照明灯具；三、利用剩余的水实施清洗,加清洗剂(无毒)对池壁及池彻底进行 洗刷,使池壁达到用手触摸无腻感,然后将污水排走,再用清水冲洗干净；四、对池壁进行消毒,用含氯量300克/升的水遇净消毒液喷于池壁四周,等 待30分钟至60分钟后,再放入少量自来水进行冲洗；五、检查溢流孔、排气孔等是否有防蚊防尘纱网，彻底打扫泵房卫生；六、冲洗完后，放干水，然后放入自来水，投入正常使用；
清洗、消毒蓄水池流程：1、杀菌方法：将整个水池用次配置成浓度为含氯（200mg/l）的溶液，对蓄水池进行浸泡杀菌，浸泡时间为40分钟，将水抽干，然后进行清洗工作。2、第二种方法：a.先将蓄水池池壁、地面用清水刷干净，刷两次。b.然后将蓄水池地面及放水泵的坑中的小石子及沙子清理出水池。c. 用次配置两桶（约30L）含氯浓度为600mg/l的溶液，将刷子泡在桶中5秒，然后将带有消毒液的刷子消毒墙面、地面，有效面积为1平米，依此累推进行清洗。重新配置相同浓度消毒液，按相同方法进行消毒。总共清洗两次。